Anthropic Research · 2026/06/08

刚刚!Anthropic给所有
AI生物智能体判了死刑!!

BioTender · 2026年6月9日
Paving the way for agents in biology — Anthropic Research, 2026/6/8
Anthropic 官方 Research 栏目,《Paving the way for agents in biology》,2026 年 6 月 8 日发布。

2026 年 6 月 8 日,Anthropic 在官方 Research 栏目发了一篇由 gget 工具作者 Laura Luebbert 领衔的新文章。

Laura Luebbert
Laura Luebbert — gget 作者,加州理工学院计算生物学家

配套抛出一个叫 VirBench 的 benchmark,把市面上叫得上名号的 AI 以及生物 Agent 全部拉到擂台上鞭了一遍——Claude Sonnet 4、Claude Opus 4.7、Biomni、Edison Analysis、GPT-5.2-pro、GPT-5.5,一个不落。

测试任务听起来很简单:从 NCBI Virus 数据库里检索符合条件的病毒序列,120 道真实题目,覆盖 40 种病原体,每一题都有人工核对过的标准答案。

NCBI Virus 数据库首页
NCBI Virus——病毒学家做监测、做诊断试剂、做训练数据的起点。一切故事的开端,也是一切混乱的开端。

结果是六个顶级 AI 及智能体平均准确率从 16.9%91.3% 不等。看起来好像没那么糟?但在病毒序列检索这件事上,可接受的准确率门槛实际上是 100%——少一条记录、多一条记录,下游的系统发育分析、诊断试剂设计、抗体覆盖率评估,全都可能跟着崩。

Anthropic 原文段落:六大模型在 VirBench 上的平均准确率介于 16.9% 至 91.3% 之间
Anthropic 原文段落。"For these data retrieval tasks, the bar is effectively 100%."

文章里给了一个具体例子。研究者用同一个 prompt 让 Sonnet 4 检索 2014 年西非埃博拉疫情的相关序列,跑了三次。第一次返回 106 条,第二次 15 条,第三次 5 条——标准答案是 266 条。然后用这三批数据各自重建系统发育树,估算疫情的最近共同祖先时间 TMRCA。手工 curated 的数据集得出的 TMRCA 是 2014 年 1 月,符合学术文献的既有结论。而 Sonnet 4 三次产出的三棵树里,有一棵直接把疫情起源推到了 1922 年

Zaire ebolavirus 系统发育树:手工查询 TMRCA 2014/01,Sonnet 4 三次跑出 2014/04、2014/02、1922/10
同一查询、同一模型、同一 prompt、三次运行——最右下角那棵树,把 2014 年西非埃博拉疫情的起源直接拉回到了 1922 年。手工核对的标准答案(左上)是 2014 年 1 月。Analysis by Gage Moreno.

同样的崩坏也发生在抗体表位分析上。同一种病毒、同一个问题、同一个模型、同一个 prompt,对 maftivimab 和 MBP134 这两个 WHO 优先治疗候选药物的耐药位点分布,Sonnet 4 跑了三次给出三个完全不同的医学判断。

Zaire ebolavirus 糖蛋白突变图谱:手工查询 vs Sonnet 4 三次运行
红色越深表示突变频率越高,球体标记 maftivimab 和 MBP134 两个抗体的结合位点。左为手工核对的金标准,右侧三张是 Sonnet 4 三次运行——三张图等于三个对治疗方案是否仍然有效的判断。Analysis by Sarah Gurev.

在 2026 年 5 月 DRC Bundibugyo 病毒疫情已经超过 1000 例、200 多死亡的当下,这种程度的不可复现性,放在公共卫生应急的关键决策窗口里,是要出人命的。

这不是模型的错,是基础设施的错

Luebbert 团队随后给所有 Agent 接入了一个叫 gget virus 的确定性检索层——这是她和 NCBI 官方合作开发的工具,专门把 NCBI Virus 网页端那些"只有老练病毒学家才懂"的过滤逻辑翻译成机器可调用的接口。

gget 工具生态:search、info、seq、ref、blast、blat、enrichr、archs4、alphafold、muscle
gget 工具生态全景——Luebbert 多年来给计算生物学家造的"高速公路系统",覆盖 Ensembl、UniProt、NCBI、UCSC Genome Browser、ARCHS4、Enrichr 等十余个数据库。gget virus 是这一家族里最新的成员。

接上之后,所有 Agent 准确率全部冲过 90%,GPT-5.5 达到 99.7%,run-to-run 的方差几乎消失,模型之间的差距也被压平。这一点对整个 AI4Bio 行业的暗示非常残酷:你花大价钱买最贵的模型,不如给便宜模型配一个对的工具。

VirBench 上 Agent 准确率:单独运行 vs 接入 gget virus 后
VirBench 准确率对比——灰色柱是 Agent 单独运行,红色斜纹柱是接入 gget virus 后。最右侧的纯红柱是直接调用 gget virus 不经过 Agent,准确率 100%。模型之间的差距被一个工具层抹平。

Luebbert 借 Andrej Karpathy 几个月前的话点题。Karpathy 抱怨过,自己 vibe-code 一个网页应用,写代码只用了一天,剩下一整周都在浏览器里点来点去配认证、配支付、配部署。他的结论是"没人应该忍受这种事,我们必须为 Agent 重新构建一切"。

Andrej Karpathy at YC AI Startup School: Software in the era of AI
Andrej Karpathy 在 YC AI Startup School 的演讲《Software in the era of AI》。生物学家比软件工程师早被同一件事折磨了十年。

生物学家比软件工程师早被这件事折磨了至少十年。NCBI Virus、GenBank、RefSeq、INSDC——这些数据库设计的时候根本没想过有一天用户会是一个 AI。它们是给有经验的人类研究员设计的,过滤逻辑藏在网页交互里,元数据字段含义靠"领域常识"补完,API 只暴露一部分功能。

所以 Anthropic 这篇文章真正判死刑的是"只要模型够强,生物数据就能自己长出腿跑过来"这个集体幻想。它给整个赛道立了一个新的评价标准:判断一个 AI4Bio 产品的能力,不能只看模型 benchmark,必须看它和底层数据基础设施的耦合质量。

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顺便两个值得品味的细节。第一,Anthropic 自家的 Sonnet 4 被反复拿出来做反面教材,脚注 4 里解释了原因:Sonnet 4 是本次评估中可用的最新 Anthropic 公开模型,因为后续模型有生物安全相关的访问限制。Opus 4.7+ 在病毒学评测场景里被 Anthropic 自己关了门。

Anthropic 原文脚注 4:Claude Sonnet 4 is the latest publicly available Anthropic model that can be used for this evaluation
原文脚注 4——一行字,半个生物安全姿态宣言。

第二,Biomni 作为开源生物 Agent 的代表被列在 benchmark 对象里,最终落点也在 22.5%——这不是 Biomni 不行,是整个赛道当下的真实状况:没有任何一个 Agent 单靠模型能力能跨过那道准确率门槛。Luebbert 的论点恰恰是替所有 Agent 团队解套:方向不在堆模型,在堆工具。

BioTender AI × Biology 编辑部 · 上海
本文基于 Anthropic Research《Paving the way for agents in biology》及配套预印本 Nasri et al., 2026 撰写