BioTender No. 全网背调 / 2026.06.09
特别报道 · AI4Science

谁代表字节 AI 制药?

顾全全离职事件背后的技术、组织与话语权,全网背调。

BioTender 编辑部 2026 年 6 月 9 日 约 3000 字

6 月 2 日,顾全全发了一封告别字节 Seed 的公开信,自述三年里做的两件事——SeedFold/SeedProteo 这条 AI 制药线,和 Seed 2.0 的 LLM 预训练优化。

顾全全 6 月 2 日的告别推文:自述三年间领衔 AI for Drug Discovery(SeedFold、SeedProteo、DPLM),以及后期转入 LLM 预训练。这是整场风波的引信。

正常情况下,大厂高管离职是一句"祝前同事前程似锦"的事。但这次走向完全不同。几天后,相关新闻媒体放出字节官方口径:"顾全全曾参与生物分子结构预测及 LLM 预训练相关工作,但并非 AI 制药和预训练业务负责人"

顾全全随即在小红书反击:

"在公司内部,我在 AI 制药方向所承担的职责和做出的贡献一直是被广泛认可的。如果确实有人向媒体传递了与此相反的信息,不仅让我感到困惑,也让许多曾经并肩奋斗的团队成员感到不解。" —— 顾全全,小红书声明

紧接着,他公开声明自己的 title:

"我就是 AI 制药负责人,这是我 2023 年 7 月加入公司就定下来的 title。" —— 顾全全,小红书评论区

这场前员工 vs 大厂围绕"谁是负责人"的公开拉锯,在国内 AI 圈极其罕见。其背后只有一种可能——字节内部,关于"谁代表 AI 制药"这件事,从来没真正达成共识。

字节 AI 制药不是一条线,是三条线

字节内部实际上有三条平行的 AI 制药线,过去三到四年同步运行,技术栈不共享、汇报线不重合、对外署名机构都不一样。

Track 01 Seed AI4S 顾全全 · 算法学术线

2023 年 7 月顾全全从 UCLA 加入字节 Seed,牵头组建。代表作 SeedFold 和 SeedProteo,宣称"超越 AlphaFold 3"、binder 设计 hit rate 70–80%。署名 ByteDance Seed,顾全全通讯。特点:学术论文驱动、刷 SOTA。

顾全全。原 UCLA 计算机终身副教授,2023 年 7 月加入字节 Seed 任 AI for Drug Discovery 负责人。
SeedFold 技术报告(2025 年 12 月发布)首页:署名 ByteDance Seed,通讯作者 Quanquan Gu。
SeedFold 在 FoldBench 上的对比:在 Monomer、Protein-Protein、Ab-Ag、Protein-Ligand 多个任务上自报数据超过 AF3、Boltz-1、Chai-1、Protenix-0.5。
Track 02 AML AI4S 肖文之 · 工程平台线

肖文之 2015 年加入字节,2021 年转 AI4S。代表作 Protenix(AF3 的 PyTorch 全开源复现,Apache 2.0)和 PXDesign(七靶点 hit rate 17–82%,超 AlphaProteo 2–6 倍)。署名 ByteDance。特点:工程化、开源、benchmark 化。

Protenix-v1 题图:早期论文署名 ByteDance Seed。
Protenix-v2(2026.04)题图:同样署名 ByteDance Seed,肖文之仍是通讯作者之一。
Track 03 Anew Labs 刘凯 · 临床管线线

也叫 Anew Therapeutics 或 ByteDance AI Drug Discovery,总部上海,办公分布上海/新加坡/San Jose,核心团队 40+ 人,新加坡注册有独立法律实体 Anew Therapeutics Pte Ltd.,已有 IL-17A/IL-17RA 抑制剂等多项专利公开。代表作 AnewOmni(500 万复合物训练的全原子统一生成模型)和 AnewSampling(全原子 MD 复现)。

BioWorld 2026 年 2 月专利数据库收录:Anew Therapeutics Pte Ltd. 合成针对 IL-17A/IL-17RA 相互作用抑制剂的杂环化合物——适应症覆盖银屑病、类风关、克罗恩病、多发性硬化等多个免疫疾病。
AnewOmni 是 Anew Labs 与清华联合发布的统一生成框架,可同时设计核酸、ncAA、纳米抗体、小分子、多肽、抗体六类分子。

Anew Labs 的实际负责人是刘凯(Kai Liu)——官网团队名单第一个名字,AnewOmni 和 AnewSampling 两篇代表论文的字节方通讯作者。署名 ByteDance AI Drug Discovery / Anew Therapeutics。特点:biotech 公司形态,做湿实验、推 IND。

三条线的技术撞车

如果分工合理,事情没那么复杂。问题是这三条线在过去一年,在同样的目标、同样的靶点上,产出了同样性质的成果,而且彼此互不引用

SeedFold 和 Protenix 都或多或少说自己超越了 AF3,在同一家公司里"互相超越 AF3",对外却谁都不提对方。SeedProteo 和 PXDesign 都做 binder 设计,重叠靶点(PD-L1、SC2RBD)各自跑了一遍湿实验。

PXDesign(肖文之这条线)的 binder 设计:IL-7RA、SC2RBD、PD-L1、VEGF-A、TrkA 五个靶点的湿实验亲和力数据,整体 hit rate 17–82%。
SeedProteo(顾全全这条线)的同期 binder 设计:PD-L1 上做到 56.9 pM,SC2RBD 做到 0.41 nM。和 PXDesign 在 PD-L1、SC2RBD 两个靶点上湿实验直接撞车。

最有意思的细节:SeedProteo 论文里 in-silico 评估用的是自家的 SeedFold,而不是同公司开源、有 webserver 的 Protenix——这种"宁可用自家不那么完善的工具也不用同事的成熟工具"的现象,只在两个团队互相不认账时才会出现。

SeedProteo benchmark 表:把 PXDesign 列为对比基线之一。两个团队的论文相互把对方降格为'参考基线',这是字节 AI4S 双轨平行的最直接证据。

更隐蔽的一条线索是 Protenix 这条工程线已经在被静默吸收。早期 Protenix 论文署名是 ByteDance AML AI4Science Team

Protenix-v1 早期 BibTeX:署名仍是 ByteDance AML AI4Science Team——肖文之这条线最初的组织归属。

到 2026 年初,Protenix 的 GitHub README 已切换为 "ByteDance Seed-AI for Science",联系邮箱也换成了 anewbt_mind@bytedance.com——anewbt 就是 Anew Labs 的 domain(anewbt.com)

Protenix 官方仓库 Contact Us:联系邮箱已切到 anewbt_mind@bytedance.com(Anew Labs 域)。这条线在过去一年事实上已经被并进了 Anew Labs 的体系,肖文之的 ownership 被稀释——这或许也是他传闻筹备创业的内部动因。

Anew Labs 又自训了第三套基础模型:AnewOmni 不用 SeedFold,也不用 Protenix,基于 500 万复合物从头训。

AnewOmni 架构图:把核酸、肽、抗体、小分子统一编码为'积木块',跨模态生成。这是字节内部第三套独立的、5M+ 复合物级别的基础模型。

换句话说,字节内部三个 AI 制药团队各自训了复合物级别的基础模型,各自打 benchmark,各自做湿实验,各自宣称 SOTA。这不是内部赛马——内部赛马至少最后要选一个赢家。这是三个团队在同一个屋顶下,各自经营一家独立的 AI 制药公司。

那么,谁是"AI 制药负责人"?

字节官方口径:没人是。官方口径那句"顾全全并非 AI 制药负责人"刻意没说"负责人是肖文之"或"是刘凯",而是消解了"负责人"这个角色本身。

顾全全自己口径:他是。亲口确认"2023 年 7 月入职就定下来的 title"。

论文署名和实际管线 ownership:更复杂——顾全全 own 的是 SeedFold/SeedProteo 这条算法学术线;肖文之 own 的是 Protenix/PXDesign 这条工程平台线;刘凯 own 的是 Anew Labs 的整个药物管线,包括 AnewOmni、AnewSampling 和 4 条 preclinical 管线

如果"AI 制药负责人"指真正在做药、对临床终点负责的人,答案或许是刘凯。如果指 title 上对应这个角色的人,答案或许是顾全全。

这就是整个故事的真正结构——title 通胀 vs 实际 ownership 错配。顾全全有 title,刘凯有管线,字节官方口径是在为后者划线、为前者去权,但又不愿意公开把刘凯抬出来。

这件事还远没有结束

顾全全下一站未公开。据 Z Finance 5 月 29 日报道,与他同批离开字节的 AI4S 成员,创业方向集中在 AI 制药、蛋白设计、生物基础模型和药物发现平台,已获头部美元机构多轮加注。

Z Finance 报道节选:多位 AI4S 成员创业并获头部机构多轮加注,说明市场仍愿意为这类能力定价。

Anew Labs 则已注册参加 6 月 San Diego 的 BIO Convention,这是它在国际 partnering 场合的首次公开亮相。

今天最值得记住的一件事是:当一家估值近 6000 亿美元的大厂,需要靠通稿和小红书撕扯才能说清"谁是 AI 制药负责人"这件事的时候,真正的答案早就已经不重要了
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