🏅 2024 Nobel Chemistry · Computational Protein Design

从零 设计 生命 的分子

David Baker,华盛顿大学蛋白质设计研究所所长。 从 Rosetta 到 RFdiffusion,用计算创造自然界从未存在过的蛋白质。 2024 年与 DeepMind 共同获得诺贝尔化学奖。

核心发明 → 诺奖时刻
SCROLL
Rosetta· Top7· Foldit· RoseTTAFold· ProteinMPNN· RFdiffusion· SKYCovione· Rosetta· Top7· Foldit· RoseTTAFold· ProteinMPNN· RFdiffusion· SKYCovione·

↕ 移动鼠标 体验 3D 倾斜

Institute for Protein Design

1993 年加入华盛顿大学,历时三十年, 将蛋白质工程从"改造自然"推向"从零创造"。

数字背后

不只是论文,是一场蛋白质设计革命

0
K+ 论文引用
0
篇学术论文
0
家 biotech 公司
0
项专利

Core Inventions · 1998–2024

三十年的
蛋白质工程里程碑

🧬 1998

Rosetta

蛋白质结构预测与设计平台。建立在"蛋白质折叠至最低能量状态"的热力学原理上,向全球学术机构免费开放。

🏗 2003

Top7

人类历史上第一个完全从零设计的蛋白质,拥有自然界从未出现过的折叠结构。证明"从第一性原理创造蛋白质"不是疯狂的想法。

🎮 2008

Foldit

将蛋白质结构优化变成在线游戏,借助人类空间直觉突破算法局限。75 万玩家参与,论文联名署名。

🧠 2021

RoseTTAFold

三轨神经网络结构预测模型,吸收 AlphaFold 灵感但有独特架构创新。完全开源。

🔄 2022

ProteinMPNN

深度学习序列设计模型——结构预测的逆问题:根据目标结构设计对应序列。广泛被工业界采用。

2023

RFdiffusion

扩散模型生成全新蛋白质骨架——等同于"DALL-E 生成蛋白质"。可按功能条件生成,已用于设计酶、疫苗、纳米颗粒。

"Large leaps paradoxically
can be easier than small ones."

— David Baker

Career Arc · 1962–2024

从哲学系学生
到诺贝尔化学奖

1962 · Seattle
出生于西雅图
父母均为华盛顿大学教授:父亲是理论物理学家,母亲是地球物理学家。
1984 · Harvard
哈佛大学生物学本科
大学初期主修社会科学,后转哲学,最终在毕业前夕决定投身科学。
1989 · UC Berkeley
博士:生化( Randy Schekman 实验室)
研究酵母中的蛋白质运输与分选。
1993 · UCSF → UW
博士后 → 加入华盛顿大学
在 David Agard 实验室完成博士后训练,加入 UW 并工作至今。
1998 · Rosetta
Rosetta 诞生
"那几乎是一个疯狂的想法——从零开始设计蛋白质。" Rosetta 将热力学原理与计算结合,成为蛋白质设计的基础设施。
2003 · Top7
首个全新折叠蛋白质
与 Brian Kuhlman 合作,Science 论文被诺贝尔委员会引用。蛋白质设计革命的标志性时刻。
2012 · IPD
创立蛋白质设计研究所
华盛顿大学 IPD 成为全球蛋白质设计研究的中心,汇聚生物化学、计算机科学、物理学、工程学。
2020 · AlphaFold2
AlphaFold2 改变了一切
DeepMind 解决了结构预测问题。Baker 没有防御性竞争,而是立即拥抱深度学习,将其引入自己的设计工具。
2022 · SKYCovione
世界首个计算设计蛋白药物获批
韩国批准 SKYCovione 疫苗,由 IPD 的 Neil King 设计纳米颗粒。计算蛋白设计进入医疗应用时代。
2024 · Nobel
诺贝尔化学奖
与 Demis Hassabis、John Jumper 共同获奖。"我妻子先反应过来,告诉我'你得奖了'。我一直以为会与 Steve Mayo 和 Bill DeGrado 共享。"
🏅 October 9, 2024

诺贝尔化学奖

大卫·贝克获得诺贝尔化学奖一半,获奖原因: "for computational protein design"—— 以计算方法从零创造全新蛋白质。

另一半授予 Demis Hassabis 与 John Jumper, 表彰 AlphaFold 对蛋白质结构预测的突破。 两项工作共同构成了蛋白质折叠问题的完整图景。

Nobel Prize 官方页面 →
🏅 Nobel Chemistry 2024 David Baker · Computational Protein Design