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Archive — AI × Biology Papers

每日论文速递归档

每日精选 bioRxiv 与 arXiv(q-bio、cs.LG)交叉领域论文,配中文编者按。选择日期查看当天速递。

所有期刊
2026-09-10
ADMET-EvO自进化科研Agent、ProMeta跨E3连接酶PROTAC预测、PPI数据捷径审计、分子生成系统评测、XAI-Refine解释知识闭环、CDT-II中心法则模型
6 篇 · 3 方向 · arXiv 4 + 已接收作者稿 2
最新
2026-09-09
PocketVE口袋条件分子生成、变尺寸三维分子潜流、BackFlip-2蛋白定向柔性、条件感知寡核苷酸模型、SureRoute可验证逆合成、Orchestra生信MCP Agent
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 54 期
2026-09-08
RFOptimization全原子结合物优化、AtlasFold开放蛋白折叠、BOTANIC-1植物基因组模型、ESMCapsid病毒衣壳模型、真实科研AI框架评测、AlphaFold复合物组装机制
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 53 期
2026-09-07
OmniSyn合成原生分子生成、ATOMICA跨分子相互作用表征、PromptBio端到端科研Agent、MErlin细菌甲基组Agent技能、InstaNovo-FM蛋白质组基础模型、MetaGNN基准失效自审计
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 52 期
2026-09-06
antiGen病毒演化预测、SPHERE敏感数据合成孪生、Transformer读取特定记忆、多尺度数字脑共模拟、语言模型增强单细胞分析、FADVI单细胞与空间组学整合
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 51 期
2026-09-05
siProGenA生成式siRNA设计、知识提示多重虚拟染色、单细胞跨域置信度审计、结构MRI基础模型基准、Karenina生物医学AI多维评测、强化学习NSCLC治疗策略
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 50 期
2026-09-04
SimpleDesign序列—结构联合生成、通用LLM从头设计配体结合蛋白、蛋白语言模型因果特征、序列—冷冻电镜跨模态检索、scMaize作物单细胞基础模型、scRep潜空间自蒸馏
6 篇 · 3 方向 · arXiv 1 + bioRxiv 5
第 49 期
2026-09-03
生成式VHH抗蛇毒、ProbeMatchDTI药物靶标匹配、亚细胞单细胞嵌入、小鼠数字孪生、反应性脑组织识别、病理切片自动分诊
6 篇 · 3 方向 · arXiv 5 + bioRxiv 1
第 48 期
2026-09-02
SymFold蛋白逆折叠、抗体功能感知表征、PathFold折叠路径、PopPert单细胞扰动、PROSPECTor开放式发现、LLM生信报告评测
6 篇 · 3 方向 · arXiv 4 + bioRxiv 2
第 47 期
2026-09-01
ProtMonomer蛋白构象预测、Vipsania无监督基因识别、C-PLANK细胞情境药物发现、PhageTransformer宿主预测、S2F-Agent基因组解释、审计式LLM蛋白质组分析
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 46 期
2026-08-30
FuncSeek蛋白功能检索、F1-ATPase机器学习工程、Corpusome微生物组语料、G2T组织空间重建、L-STAR空间域Visual LLM、OmniScore通用复合物评分
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 45 期
2026-08-29
多肽提示蛋白语言模型、CysLENS半胱氨酸配体化、RCDO闭环药物优化、InsilicoCell多目标筛选、OmicsFM蛋白质组基础模型、ASAREE科研Agent评测
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 44 期
2026-08-28
RegimeFormer蛋白扰动图谱、蛋白语言模型几何解释、GRAS离散扩散引导、PathoMIC跨物种抗菌肽、Gemini闭环科学家、GITIII泛癌空间组学
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 43 期
2026-08-27
蛋白高阶上位性、蛋白语言模型嵌入解释、BixBench3研究级Agent、蛋白表征协同科学家、UTR-Diffusion、RNA产量深度学习优化
6 篇 · 3 方向 · arXiv 5 + bioRxiv 1
第 42 期
2026-08-26
Foldseek-Interface蛋白接口检索、RegTrust-XAI调控序列可信度、虚拟细胞干预几何、RevPert逆向扰动、RADF空间扰动补全、BioKERN病理-转录组表征
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 5 + arXiv 1
第 41 期
2026-08-25
CodonMamba可编程mRNA设计、iSCALE蛋白-RNA亲和力、抗体共折叠基准、小分子模型验证协议、单细胞药物响应机制基准、珠蛋白变体实验-AI框架
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 40 期
2026-08-24
大环分子胶从头设计、InterPLM神经肽特征、EnzymARC酶功能压力测试、Pfam对比ESM基因簇检索、scAraFM跨实验评测、GEOMeta转录组Agent
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 39 期
2026-08-23
癌症表面蛋白AI minibinder、BMP-2结合蛋白、FAR-DPO环肽设计、PETA虚拟筛选、DNA-MFM多模态基因组基础模型、Brain Researcher可审计科研Agent
6 篇 · 3 方向 · arXiv 3 + bioRxiv 2 + 期刊 1
第 38 期
2026-08-22
蛋白语言模型越界崩塌、结构预测方法演进、NACraft核酸适配体设计、自催化异肽键蛋白组装、HI-JEPA分子组织世界模型、规模化蛋白实验验证
6 篇 · 3 方向 · arXiv 2 + bioRxiv 3 + 期刊 1
第 37 期
2026-07-30
PG-LLM通用语言模型蛋白质变异排序基准(Claude Opus 5对比GPT-5.6)、HydrAffinity免制备MoE配体亲和力预测、跨物种蛋白token单细胞基础模型、UDIST无监督形状纹理解耦、腹部MRI自监督疾病关联、水稻染色质DNA语言模型
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 36 期
2026-07-27
AINN-Express纳米抗体表达预测、GatorPrism空间多组学专家路由整合、Tx2Mol表型驱动分子从头设计、MetaClaw可审计元基因组AI Agent、Graph in Graph全人医疗组学图AI框架、FusedFCR细胞命运轨迹标志物选择
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 35 期
2026-07-25
CHIMIYA-1 ADMET属性预测基础模型基准、X-PAIR蛋白质组尺度PPI网络重建、蛋白语言模型概念获取分层解剖、生殖系捷径揭示PLM免疫受体检索局限、AlphaMissense癌症驱动突变逐基因校准、pHaseMD4AI生物分子AI数据集
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 34 期
2026-07-22
Diff-Switch扩散模型从头设计蛋白开关、SPgen全蛋白质组空间蛋白质组学生成、ProtSyntax蛋白LLM解码PTM语法、偏好学习抗体表达排序、MechAInistic LLM多智能体代谢建模、grapHiC对比学习单倍型分相
6 篇 · 3 方向 · arXiv 2 + bioRxiv 4
第 33 期
2026-07-20
Agentic Genomics自主验证范式、PlasmidGPT质粒生成式语言模型、scVision单细胞视觉基础模型、DyneTrion蛋白质动力学时空生成模拟器、PrimeKG-Plus精准医学知识图谱扩展、长读长+机器学习检测非常规DNA构象
6 篇 · 3 方向 · arXiv 2 + bioRxiv 2 + 期刊 2
第 32 期
2026-07-18
PFM扰动流匹配结构药物设计、CAR-T细胞基础模型预测免疫治疗响应、Σ0-EvoCell统一进化与细胞生物学AI本体、Evo 2病毒基因组架构编码基准、CasanovoGUI深度学习多肽测序、SST-MAE植物高光谱自监督表型学习
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 31 期
2026-07-17
语言与生物基础模型跨域迁移不对称性、STORM空间拓扑结直肠癌motif发现、AI重建3D单细胞空间多组学、FUSED配体结合位点功能表征、阿尔茨海默病脂质小胶质细胞多组学调控网络、PFAS虚拟扰动银屑病机制
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 30 期
2026-07-16
AlphaFold3能力边界系统评估、物理生成式配体结合蛋白设计、冻结蛋白基础模型嵌入抗体亲和力排序、MolMAE表面多模态分子表征、Perturb-seq可靠性加权靶点排序、单细胞网络锁定阿尔茨海默病调控因子
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 29 期
2026-07-13
Baker实验室从头设计激酶调控蛋白、TheBioCollection生物LLM语料库、Generalized Poisson Flow变长蛋白设计、DrugGen 2疾病感知药物生成、AbICL抗体亲和力排序、仿真引导临床试验设计
6 篇 · 3 方向 · arXiv 4 + bioRxiv 1 + Nature 1
第 28 期
2026-07-12
InferAging 衰老时钟、HLA-E/NKG2A 膀胱癌免疫治疗、NAZ-mAb 计算抗体设计、PerturbMatch Perturb-seq 统计框架、TRACR 跨突触追踪、AGPI AI 病原体平台
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 27 期
2026-07-11
CellTok 单细胞 LLM、MIA 多组学张量学习、EVEE Evo 2 变体效应、Nammu 宏基因组 Mamba、SPARC 轨迹重建、cfDNA fragmentomics 早产预测
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 26 期
2026-07-10
IgGM2 免疫受体全原子设计、EZSolver 酶促机理 flow matching、Ensemble QSP 多智能体、DNA 甲基化衰老轨迹、BINNs 原理、贝叶斯 RMSD
6 篇 · 3 方向 · arXiv 4 + bioRxiv 2
第 25 期
2026-07-08
酶特异性AI基准、OpenDDE开源药物发现引擎、MolBasic分子LLM结构识别、乳腺癌MRI潜在表型、帕金森可解释ML、生物参数流形
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 24 期
2026-07-07
TESSERA 癌症基因组基础模型、PhenoMap 表型推断、RNA 假结 DL 设计、TifBERT、SHERLOC ctDNA 生存分析、ConnectoFM 连接组 EM
6 篇 · 3 方向 · bioRxiv 6
第 23 期
2026-07-06
TRIOPS TCR-MHC深度学习、CRISPRko vs CRISPRi Perturb-seq、超急性脑卒中空间代谢组、神经错误行为解码、结构化高斯过程
6 篇 · 3 方向 · arXiv 1 + bioRxiv 5
第 22 期
2026-07-05
月度盘点 · NewLimit 重编程、Lila Sciences AI 科学工厂、Nabla Bio KRAS 抗体、Biohub 穿颅超声、NVIDIA BioNemo
6 则 · 3 方向 · 行业动态
第 21 期
2026-07-04
Affinage LLM 基因注释、GlycoMAC 糖基化预测、scMTNI 动态 GRN、MERLIN-SUITE TF 活性建模、双曲 EEG 抑郁识别
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 20 期
2026-07-03
SF-Cluster 蛋白质构象、SynLaD 可合成分子、Active-GRPO 分子优化 RL、癌症药物响应 XAI、神经科学工具
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 19 期
2026-07-02
可解释 TCR-表位预测、细胞周期感知药物扰动、AD 反应扩散模型、帕金森 SAE 图像对齐、表格 ICL 蛋白质适应性
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 18 期
2026-07-01
虚拟脑孪生隐私建模、疫苗表位主动学习、KAN 单细胞聚类、病理分子联合预测、质谱目标检测
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 17 期
2026-06-30
蛋白质 RL 微调、Boltz-2 可解释、拟南芥 G2P 基准、进化中间体重建、NSCLC 病理 AI
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 16 期
2026-06-29
非规范抗菌肽 Agent、PPI 层次建模、医学 VQA 校准、H5N1 传播、冷冻电镜信息论
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 15 期
2026-06-28
化合物库风险感知优先化、泛基因组存储加速、形态进化推断、应激 CNN
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 14 期
2026-06-27
单细胞 AI 评测、未见扰动预测、耐药神经符号、自动认知科学家
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 13 期
2026-06-26
分子基础模型 Molexar/BioMatrix、DNA 编码库设计、出生缺陷 AI 诊断
6 篇 · 3 方向 · arXiv 6
第 12 期
2026-06-25
MIRA/AMIE 超越医生、自主 AI 科学家、NatureBench、Enveda
7 条 · 4 方向 · Nature 2 + JAMA 1 + arXiv 2 + 产业 2
第 11 期
2026-06-24
单细胞多组学基础模型、scFM 基准、肽 Agent、蛋白质无序区
12 篇 · 4 方向 · bioRxiv 9 + arXiv 3
第 10 期
2026-06-23
流式细胞仪基础模型、耐药 Agent、CDK4 分子胶、脑干图谱
10 篇 · 4 方向 · bioRxiv 10
第 9 期
2026-06-22
抗体扩散模型、RNA 稳定性、单细胞蛋白组学
18 篇 · 6 方向 · bioRxiv 10 + arXiv 8
第 8 期
2026-06-21
大环肽设计、免疫分类、分子力场、视觉皮层
8 篇 · 4 方向 · bioRxiv 5 + arXiv 3
第 7 期
2026-06-20
RNA 优化、DNA 甲基化时钟、抗体数据库、MEG
8 篇 · 4 方向 · bioRxiv 6 + arXiv 2
第 6 期
2026-06-19
蛋白 LM 电路追踪、分子生成、微流控、临床 AI
9 篇 · 4 方向 · bioRxiv 2 + arXiv 7
第 5 期
2026-06-18
疫苗 GNN、跨物种空间转录组、NRPS 密码、ViT 可解释性
10 篇 · 5 方向 · bioRxiv 10
第 4 期
2026-06-17
PROTAC 扩散模型、空间转录组校正、tRNA 纳米孔、脑启发 ANN
10 篇 · 5 方向 · bioRxiv 8 + arXiv 2
第 3 期
2026-06-16
实验室自动化 Agent、非规范氨基酸结构预测、单细胞稀疏自编码器
12 篇 · 5 方向 · bioRxiv 10 + arXiv 2
第 2 期
2026-06-15
蛋白质设计、单细胞扰动、神经科学与脑机接口
19 篇 · 6 方向 · bioRxiv 10 + arXiv 9
第 1 期